Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Exo5Q9CXP9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Exo5Q9CXP9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms