Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rpusd4Q9CWX4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rpusd4Q9CWX4 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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Rpusd4Q9CWX4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpusd4Q9CWX4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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