Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU4

UPF0690 protein C1orf52 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CWU4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Q9CWU4 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms