Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NubplQ9CWD8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms