Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ykt6Q9CQW1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms