Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Smim8Q9CQQ0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms