Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rdm1Q9CQK3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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