Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Tmed6Q9CQG0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed6Q9CQG0 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms