Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nudt21Q9CQF3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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