Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rab5aQ9CQD1 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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