Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atg3Q9CPX6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms