Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt23Q99PS0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Krt23Q99PS0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms