Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup155Q99P88 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup155Q99P88 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup155Q99P88 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup155Q99P88 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup155Q99P88 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup155Q99P88 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup155Q99P88 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Nup155Q99P88 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Nup155Q99P88 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms