Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Mrpl3Q99N95 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Mrpl3Q99N95 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Mrpl3Q99N95 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms