Protein–RNA interactions for Protein: Q99M73

Krt84, Keratin, type II cuticular Hb4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt84Q99M73 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Krt84Q99M73 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt84Q99M73 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms