Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rcbtb2Q99LJ7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rcbtb2Q99LJ7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Rcbtb2Q99LJ7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Rcbtb2Q99LJ7 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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