Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pagr1aQ99L02 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms