Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps4Q99KG7 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps4Q99KG7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms