Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Cldn16Q925N4 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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