Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rnf144aQ925F3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf144aQ925F3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms