Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Csmd1Q923L3 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms