Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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Usb1Q91W78 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Usb1Q91W78 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Usb1Q91W78 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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