Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28065-201ENSMUST00000185290 833 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm34701-201ENSMUST00000204213 849 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl42-202ENSMUST00000217777 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45356-201ENSMUST00000209274 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm11588-201ENSMUST00000141758 658 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 4930440I19Rik-202ENSMUST00000145972 676 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms