Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubxn4Q8VCH8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms