Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ApobrQ8VBT6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ApobrQ8VBT6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms