Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Colec12Q8K4Q8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms