Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrrtm1Q8K377 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Lrrtm1Q8K377 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Lrrtm1Q8K377 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Lrrtm1Q8K377 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Lrrtm1Q8K377 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Lrrtm1Q8K377 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Lrrtm1Q8K377 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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