Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Fbxo18Q8K2I9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Fbxo18Q8K2I9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fbxo18Q8K2I9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms