Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Brd3Q8K2F0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms