Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Abcf3Q8K268 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms