Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Nek9Q8K1R7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek9Q8K1R7 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.2 ms