Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FgbQ8K0E8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms