Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Pkn3Q8K045 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms