Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAF4

Nhsl1, NHS-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,587 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhsl1Q8CAF4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Zfp809-201ENSMUST00000072465 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nhsl1Q8CAF4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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