Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ppfibp1Q8C8U0 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ppfibp1Q8C8U0 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms