Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Sfrp1Q8C4U3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Sfrp1Q8C4U3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms