Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Snx16Q8C080 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Snx16Q8C080 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms