Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXG3

Ift57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift57Q8BXG3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ift57Q8BXG3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms