Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ctdsp2Q8BX07 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms