Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Snx17Q8BVL3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Snx17Q8BVL3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx17Q8BVL3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Snx17Q8BVL3 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Snx17Q8BVL3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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