Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdcl3Q8BVF2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms