Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Zfp398Q8BV16 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Zfp398Q8BV16 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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