Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp43Q8BUM9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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Usp43Q8BUM9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Usp43Q8BUM9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp43Q8BUM9 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp43Q8BUM9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp43Q8BUM9 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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Usp43Q8BUM9 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Usp43Q8BUM9 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Usp43Q8BUM9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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Usp43Q8BUM9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp43Q8BUM9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp43Q8BUM9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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Usp43Q8BUM9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Usp43Q8BUM9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms