Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c4Q8BMQ2 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c4Q8BMQ2 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gtf3c4Q8BMQ2 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gtf3c4Q8BMQ2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms