Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cyp4f39Q8BGU0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms