Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Atg4bQ8BGE6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms