Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg2bQ80XK6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Atg2bQ80XK6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms