Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Ttc28Q80XJ3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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