Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbed4Q80WQ9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Zbed4Q80WQ9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 514 ms