Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AknaQ80VW7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AknaQ80VW7 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AknaQ80VW7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
AknaQ80VW7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AknaQ80VW7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
AknaQ80VW7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AknaQ80VW7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms